Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRAMEF22A3QJZ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms