Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms