Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQ87 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQ87 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQ87 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
U3KQ87 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
U3KQ87 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
U3KQ87 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
U3KQ87 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQ87 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQ87 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQ87 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQ87 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQ87 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQ87 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQ87 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
U3KQ87 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
U3KQ87 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
U3KQ87 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms