Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP3Q9Y6F1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms