Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPQQ9Y646 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms