Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX9Q9Y5X1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX9Q9Y5X1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms