Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPRBQ9Y5M8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPRBQ9Y5M8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms