Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARP1Q9Y4F1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms