Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms