Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG6Q9Y2V7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COG6Q9Y2V7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG6Q9Y2V7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms