Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAN1Q9Y2M0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAN1Q9Y2M0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAN1Q9Y2M0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAN1Q9Y2M0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAN1Q9Y2M0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms