Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC5Q9UQL6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HDAC5Q9UQL6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms