Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPG7Q9UQ90 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SPG7Q9UQ90 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPG7Q9UQ90 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms