Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM35Q9UPQ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM35Q9UPQ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms