Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB23Q9ULC3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB23Q9ULC3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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