Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms