Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms