Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MRTO4Q9UKD2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRTO4Q9UKD2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms