Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms