Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX20Q9UHI6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX20Q9UHI6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms