Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNA9Q9UGM1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA9Q9UGM1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms