Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK2Q9UBU2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms