Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms