Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD7Q9P2D1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms