Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAPAQ9P0L0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms