Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKIRAS2Q9NYR9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms