Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RDH8Q9NYR8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms