Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT1Q9NXH9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms