Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMPD4Q9NXE4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms