Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM260Q9NX78 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms