Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB20Q9NX57 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms