Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDIT4Q9NX09 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDIT4Q9NX09 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms