Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ASF1BQ9NVP2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms