Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKDREJQ9NTG1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKDREJQ9NTG1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms