Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAMSN1Q9NSI8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMSN1Q9NSI8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms