Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC13Q9NSE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC13Q9NSE7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms