Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND1Q9NSA2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms