Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB6BQ9NRW1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms