Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM1Q9NRU3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNNM1Q9NRU3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms