Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDLIM7Q9NR12 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDLIM7Q9NR12 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms