Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD93Q9NPY3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD93Q9NPY3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD93Q9NPY3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD93Q9NPY3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD93Q9NPY3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD93Q9NPY3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD93Q9NPY3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms