Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms