Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms