Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms