Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB18Q9NP72 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms