Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A2Q9HAB3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A2Q9HAB3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms