Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKRIP1Q9H875 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms