Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SENP3Q9H4L4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SENP3Q9H4L4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP3Q9H4L4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms