Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms