Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP62CLQ9H1M0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP62CLQ9H1M0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms